Koperasi SANTUN YaPEIM Berhad didaftarkan di bawah Suruhanjaya Koperasi Malaysia pada 18 Okt 2011 dengan no pendaftaran 201171600571 (koperasi kredit) yang mana merupakan salah satu agensi dibawah kawalan YaPEIM dan beroperasi di Mentari Business Park, Dataran Mentari, Sunway Petaling Jaya.

Pada awal penubuhannya, anggota-anggota koperasi terdiri dari kalangan peserta Skim SANTUN (Skim Kecemerlangan Pelajar Yatim/Miskin) yang merupakan salah satu program di bawah Yayasan Pembangunan Ekonomi Islam Malaysia (YaPEIM) seramai lebih lima ribu orang anggota.

Tujuan penubuhan adalah sebagai satu wadah atau platform kepada peserta-peserta SANTUN membuat perancangan strategik untuk menggerakkan aktiviti yang berdaya saing serta mendapat pulangan yang kompetitif dengan menggembleng tenaga-tenaga pakar dari anggota-anggota Koperasi yang terdiri daripada kumpulan yang mempunyai tahap pelajaran tinggi dan berkebolehan dalam pelbagai bidang.